その際、水鳥の取扱いについて、以下のように留意しています。

• ダンボール箱に新聞紙、ちり紙を敷き、暗くて温かい．（25℃程度）状態で体力の回復を待つ。
• 絶対に水洗いはせず、タオルや布で口部および鼻孔に付着している汚れを拭き取る。
• 鳥が油に汚染した場合、水分が皮膚まで容易に達し体温の低下をまねく。対応策として水分や汚れを拭き取るときは、必ず羽毛の育成する方向に沿って、前方から後方へしぼるように拭き取る。その際、羽の微細構造を破壊してしまうので決して擦ってはいけない。
• ダンボール箱を密封する場合は、両側に鉛筆大の穴を10個程度開ける。
• 原則として1箱に1羽を入れる。鳥が少しの余裕を持ってすっぽり入る程度の大きさがよく、箱の中で鳥が羽を広げたり、歩き回れるのは大きすぎる。
• 車で搬送する場合は、25℃程度に温める。　

日本野鳥の会福井県支部では、水鳥の汚染状況調査を含む定期的なパトロールおよび保護・回収された水鳥の種の同定について協力しました。

1月9日に、最初に保護・回収されたのはミツユビカモメ、ウミスズメ、アカエリカイツブリでした。個体数は、徐々に増加し1月15日に20羽と最も多く、2月2日まで1日あたり平均6.2羽の個体が保護・回収されましたが、2月3日以後は、多くて1日あたり3羽となっています。最後に保護されたのは、3月10日のウミネコでした。

初期は、アカエリカイツブリとウミスズメが大半を占め、次いでウトウが多くなり、15日めを過ぎるとオオハム類が、そして20日めを過ぎるとウミネコが多くなりました。

最終的に、重油の付着・汚染で、計5目6科19種170羽の水鳥が保護・回収されました。その多くは海洋性の種で、ウトウ53羽（31.2％）、ウミスズメ25羽（14.7％）、シロエリオオハムまたはオオハム計24羽（計14.1％）、アカエリカイツブリ21羽（12.4％）などで、それらで全個体数の86.4％を占めています。

保護・回収された個体のうち98羽（57.6％）が、発見時すでに死亡していました。死体で回収された割合は、ウトウで最も高くて98.1％を占め、次いで、シロエリオオハム（54.5％）、ウミスズメ（44.0％）などとなっていました。