| 番号 | 魚種 | 第1回 | 第2回 | 全調査 | 番号 | 魚種 | 第1回 | 第2回 | 全調査 |
| 1 | スナヤツメ | ○ | ○ | 27 | ギンブナ | ○ | ○ | ||
| 5 | イワナ | △ | △ | フナ類 | ○ | ||||
| ヤマメ | ○ | ○ | ○ | 30 | ヤリタナゴ | ○ | ○ | ○ | |
| アマゴ | ● | ● | 34 | ドジョウ | ○ | ○ | ○ | ||
| 9 | アユ | ○ | ○ | ○ | 35 | シマドジョウ | ○ | ○ | ○ |
| 11 | シラウオ | ○ | ○ | 36 | ホトケドジョウ | ○ | ○ | ||
| 12 | ウグイ | ○ | ○ | ○ | 52 | ドンコ | ○ | ○ | |
| 13 | アブラハヤ | ○ | ○ | 53 | トウヨシノボリ | ○ | ○ | ||
| 14 | タカハヤ | ○ | ○ | ○ | ヨシノボリ類 | ○ | |||
| 15 | オイカワ | ● | ● | ● | 55 | ヌマチチブ | ○ | ○ | |
| 16 | カワムツB型 | ○ | ○ | 59 | ウキゴリ | ○ | ○ | ||
| カワムツ類 | ○ | ウキゴリ類 | ○ | ||||||
| 17 | ハス | ○ | ○ | 66 | カマキリ | ○ | ○ | ||
| 20 | カマツカ | ○ | ○ | 科数 | 5 | 8 | 8 | ||
| 21 | タモロコ | ○ | ○ | 総魚種数 | 14 | 23 | 25 | ||
| 26 | コイ | ○ | ○ | 移入魚種数 | 1 | 2 | 2 | ||
| 在来魚種数 | 13 | 21 | 23 | ||||||
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